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補助金と助成金の違いを徹底解説!会計・税務上の正しい処理方法を税理士が教えます!

「補助金と助成金って、よく聞くけれど違いがよく分からない」
「会計処理や税金のことも気になるけど、どこから手をつけたらいいのか…」

そう思っている小規模法人や個人事業主の方も多いのではないでしょうか?

確かに、補助金も助成金も「もらえるお金」という意味では似ています。
しかし、実は制度の背景や申請方法、そして経理・税務上の取り扱いには、はっきりとした違いがあります。

この違いを理解しておかないと、「使える制度を見逃してしまう」「税務調査でトラブルになる」「決算や確定申告の際に混乱する」といったリスクが出てきます。

本記事では、税理士の視点から、補助金と助成金の違いを明確に解説した上で、
実際の会計処理や税務上の注意点、仕訳例まで丁寧にご紹介します。

読み終えるころには、あなたの事業でもどんな制度が使えそうか、そしてどう処理すればいいかがすっきり分かるはずです。ぜひ最後までご覧ください。

補助金と助成金の違いとは

実施管轄・目的の違い

補助金は主に経済産業省や中小企業庁・自治体が実施し、中小企業の設備投資や生産性向上など経済活性化が目的です。
一方、助成金は主に厚生労働省が管轄し、雇用対策・人材育成・労働環境改善が目的となります
 

採択要件・支給額・受付期間の違い

補助金は公募形式で、審査によって採択が決まるため、申請しても落ちるケースがあります。
一方助成金は、要件を満たせば原則支給される制度が多く、採択率が高いのが特徴です。

補助金は数百万円〜数千万円と高額になることが多く、一定期間・募集期間が限定されます。
対して助成金は数十万円〜百万円程度で、通年で申請できる制度も多い傾向です。

最近ではコロナ禍に出た事業再構築補助金などは限度額が1億円以上となっておりました。(中堅企業クラス)

会計処理の基本

勘定科目:雑収入・未収入金・事業主借

受け取った補助金・助成金は、「雑収入」として営業外収益に計上するのが通常です。支給決定後、入金が決算期をまたいでいる場合は、一度「未収入金」で計上しておいて、翌期の入金時に消し込みます。

個人事業主が事業と関連しない給付金を受け取った場合、「事業主借」で処理することもあります。(コロナ禍に一律10万円支給された特別定額給付金なんかがそうでした。)

入金タイミングと決算を跨ぐ処理

補助金・助成金は精算払い(後払い)が原則で、事務処理の都合上、数ヶ月〜1年以上遅れて入金されることもあります。そのため、決算期を跨ぐことがあり、未収金計上の有無が重要です 。

ここを入金時に収益計上という会計処理を行ってしまいますと「期ズレ」という扱いになってしまい、税務調査で収益の計上漏れと判断されてしまいますので注意しましょう!

 

税務上の留意点

所得税・法人税の課税対象

受給した補助金・助成金は、法人税/所得税の課税対象(益金)となります。
ただし、一部非課税の制度(例:生活保護給付金)は除かれます

消費税の扱い

補助金・助成金は、物の提供やサービスとの対価ではないため、消費税は不課税(消費税がかからない)という扱いになります。

大抵の場合、会計ソフトは雑収入の科目は消費税のデフォルトの扱いが課税売上なので注意が必要です。(補助科目に「補助金・助成金」を作って、その場合には消費税を対象外に設定しておくのも良いですね。)

圧縮記帳による税負担軽減

設備取得のための補助金を受けた場合、圧縮記帳制度を利用して、受給額分を圧縮損として処理可能です。これにより、資産の帳簿価額を圧縮し、初年度の課税所得を抑えることができ、税負担を緩和できます

この辺の処理は正直、税理士がついていないと苦しいかと思います。事前に税理士に相談するのが良いと思われます。

会計・税務処理の具体的な仕訳例

〈例1〉補助金50万円が入金された場合

借方:普通預金 500,000円 貸方:雑収入 500,000円

〈例2〉助成金30万円の支給決定通知後、未収金処理

(支給決定時)
借方:未収入金 300,000円 貸方:雑収入 300,000円

(入金時)
借方:預金 300,000円 貸方:未収入金 300,000円

 

〈例3〉個人事業主が事業関連ない給付金10万円を個人口座で受領

借方:預金 100,000円 貸方:事業主借 100,000円
 

〈圧縮記帳の仕訳例〉

機械装置を1,500万円で取得し、補助金500万円を受給した場合:

借方:機械装置 15,000,000円 貸方:預金 15,000,000円

借方:機械圧縮損 5,000,000円 貸方:機械装置 5,000,000円

借方:減価償却費 (例:1,000万円÷耐用年数) 貸方:機械装置 毎年分

注意点とアドバイス

  • 目的外使用の禁止
    当たり前の話かもしれませんが、申請要件で定められた使途以外に流用すると、返還を求められる可能性があります

  • 総額主義で記帳
    補助金使用分だけ、費用と収益を相殺せず、必ず純額で計上すること(総額主義)が上げられます

  • 決算期と収益処理のズレ調整
    税務上の特例で、費用と確定義務がずれた場合も、費用と収益を同一年度で相殺できるケースがあります
    。(法人税上の原則として費用収益対応の原則があるためです。)

まとめ

補助金と助成金は、実施管轄・目的・採択方式・金額規模・受付期間が異なります。

会計処理では、「雑収入」または「未収入金」「事業主借」を適切に使い分け、税務上も所得税/法人税の課税対象になる点や消費税非課税の性質を理解しておくことが大切です。

設備投資型の制度では圧縮記帳を活用することで初年度の税負担を和らげる戦略もあります。

正確な処理を行えば、補助金・助成金は事業成長の大きな力になりますので、補助金や助成金の検索サイトなども頻繁にチェックしてみるのも良いかもしれませんね。

お客様でも補助金と助成金を混同されていらっしゃ方が多いので今回は解説してみました。

今後も会計や税務に関して、読者の方に分かりやすい記事をお伝えしてまいります。

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高橋 輝雄
財務参謀(社外CFO) / 税理士 / 元SE。東京都中央区(茅場町)を拠点に活動 。元システムエンジニアという異色の経歴を持ち、SE出身の論理的思考と10年の税理士実務を融合させた「現預金最大化」の専門家 。 単なる過去の記録係ではなく、未来のキャッシュを創る軍師として、独自開発の『シミュレーター』と15以上の財務施策を駆使し、中小企業の資金繰りを劇的に改善 。 これまでに500件以上のマイクロ法人を支援してきた実績を持ち、情に厚く、社長の志に伴走する涙もろい財務参謀です。